創辦人證嚴法師秉持「無緣大慈，同體大悲」之精神，從事濟貧教富，慈善救人的志業，深深體會疾病是痛苦的根源，貧窮的由來，因此在慈濟綜合醫院落成啟用之後，於1994年興辦慈濟醫學院，以慈悲喜捨之精神，為社會培育「尊重生命，以人為本」懷抱濟世助人理念，實踐志工服務精神的優秀人才。 1998年8月1日更名為「慈濟醫學暨人文社會學院」。 2000年8月1日更名為「慈濟大學」，包括醫學院、生命科學院、人文社會學院及教育傳播學院。 2000年9月「慈濟大學附屬中學、實驗國民小學」創校。實現「教育完全化」理想。 2007年9月 新增人文社會學院校區。 2011年8月1日 慈濟大學附屬高級中學及慈濟大學實驗國民小學等2校存續合併為慈濟大學附屬高級中學(附設國民小學部)。 2011年9月2日更名為「慈濟學校財團法人慈濟大學」。